L’ immunoistochimica permette di chiarire tramite la valutazione dell'espressione di specifiche proteine   presenti nei tessuti, la natura delle cellule  quando l'esame morfologico non risulta  sufficiente.

La tecnica si basa sulla reazione tra  l'antigene e l'anticorpo ed evidenzia se la  proteina in esame è presente nel campione  ed dove essa è eventualmente localizzata (membrana cellulare, citoplasma, nucleo,  tessuti extracellulari).

Le maggiori applicazioni dell’  immunoistochimica sono rappresentate dall'identificazione della natura di tumori maligni aplastici (es: linfomi, carcinomi,  melanomi), nella caratterizzazione di  neoplasie del sistema emo-linfopoietico (es: linfomi, leucemie), nell'identificazione dell'  origine di una metastasi, utilizzando  marcatori tessuto-specifici,  nell'identificazione di agenti microbici (es: virus, batteri, protozoi).